Sultan: kepala negara dan kepala pemerintahan yang memiliki kekuasaan absolut dalam pemerintahan Kesultanan Yogyakarta.

Sri Paduka Pakualam: wakil Sultan yang membantu dalam menjalankan pemerintahan, terutama dalam bidang keuangan.

Dewan Pembina: terdiri dari para pembesar dan pejabat tinggi Kesultanan Yogyakarta yang berperan sebagai penasihat Sultan dalam hal-hal strategis.

Dewan Raja: terdiri dari para pangeran dan pejabat tinggi Kesultanan Yogyakarta yang membantu Sultan dalam menjalankan pemerintahan sehari-hari.

Dewan Agung: lembaga yang terdiri dari para ulama dan tokoh agama yang berperan dalam memberikan nasihat kepada Sultan dalam hal-hal yang berkaitan dengan agama.

Birokrasi: terdiri dari pejabat-pejabat pemerintahan yang bertugas dalam bidang administrasi, keuangan, dan hukum.

Pasukan Keraton: berperan sebagai keamanan Kesultanan Yogyakarta dan juga turut serta dalam upacara-upacara keraton