Jawaban:

Elektroforesis hampir selalu dilakukan dalam gel dan tidak dalam larutan. Hal ini dikarenakan gel dapat mengurangi arus listrik yang timbul akibat perbedaan suhu yang kecil yang diperlukan agar pemisahan menjadi efektif, gel bertindak sebagai saringan molekul yang meningkatkan pemisahan (Stryer, 2000), gel juga dapat menjaga molekul yang telah terpisah supaya tidak berdifusi terlalu cepat ke dalam fase cair (Lehninger, 1982).

Penggunaan poliakrilamid mempunyai keunggulan dibandingkan dengan gel lainnya, karena tidak bereaksi dengan sampel dan tidak membentuk matrik dengan sampel, sehingga tidak menghambat pergerakan sampel yang memungkinkan pemisahan protein secara sempurna. Selain itu, gel poliakrilamida ini mempunyai daya pemisahan yang cukup tinggi. Penggunaan SDS berfungsi untuk mendenaturasi protein karena SDS bersifat sebagai deterjen yang mengakibat ikatan dalam protein terputus membentuk protein yang dapat terelusi dalam gel begitu juga mercaptoetanol.

Komponen penting yang membentuk gel poliakrilamida adalah akrilamida, bisakrilamida, ammoniumpersulfate dan TEMED (N,N,N’,N’tetrametilendiamin). Akrilamida sebagai senyawa utama yang menyusun gel merupakan senyawa karsinogenik. Ammonium persulfate berfungsi sebagai inisiator yang mengaktifkan akrilamida agar bereaksi dengan molekul akrilamida yang lainnya membentuk rantai polimer yang panjang. TEMED berfungsi sebagai katalisator reaksi polimerisasi akrilamid menjadi gel poliakrilamid sehingga dapat digunakan dalam pemisahan protein. Bis‐akrilamida berfungsi sebagai cross‐linking agen yang membentuk kisi‐kisi

bersama polimer akrilamida. Kisi‐kisi tersebut berfungsi sebagai saringan molekul protein.